Paquet : gatb-core (1.4.1+git20181225.44d5a44+dfsg-3)

[ Paquet source : gatb-core  ]

boite à outils génomique avec le graphe de de Bruijn

Le projet GATB-CORE fournit un ensemble d’algorithmes très efficaces pour analyser des ensembles de données de NGS. Ces méthodes permettent l’analyse d’ensembles de données de toutes tailles sur des ordinateurs de bureau multicœurs, y compris de quantités très importantes de données de lecture provenant de n’importe quel organisme tel qu’une bactérie, une plante, un animal ou même un échantillon plus complexe (par exemple, un métagénome). Plus d’informations sur GATB sont disponibles sur https://gatb.inria.fr/. En lui-même, GATB-CORE n’est pas un outil d’analyse NGS. Cependant, il peut être utilisé pour créer un tel outil. Il existe déjà un ensemble d’outils prêts à l’emploi basés sur la bibliothèque GATB-CORE : consulter https://gatb.inria.fr/software/.

Autres paquets associés à gatb-core

• dep: libc6 (>= 2.27)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [non i386]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]

• dep: libhdf5-103

  Hierarchical Data Format 5 (HDF5) - runtime files - serial version

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libsz2

  bibliothèque de codage entropique adaptatif — SZIP

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger gatb-core

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1 867,1 ko	15 387,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1 761,6 ko	14 923,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1 896,8 ko	14 956,0 ko	[liste des fichiers]