Paquet : r-bioc-bitseq (1.26.1+dfsg-1)

[ Paquet source : r-bioc-bitseq  ]

inférence de transcription d’expression et analyse pour des données de RNA-seq

Le paquet BitSeq est destiné à l’analyse d’expression de transcription et l’analyse d’expression différentielle de données de RNA-seq data dans un processus en deux étapes. Dans la première, il utilise la méthode d’inférence bayésienne pour inférer l’expression de transcriptions individuelles d’expériences de RNA-seq particulières. La seconde étape de BitSeq englobe l’analyse d’expression différentielle d’expression de transcription. Fournissant une expression estimée à partir de réplications dans plusieurs conditions, le modèle Log-Normal des estimations est utilisé pour déduire l’expression de transcription d’espérance conditionnelle et classer les transcriptions en se basant sur la probabilité de l’expression différentielle.

Autres paquets associés à r-bioc-bitseq

• dep: libc6 (>= 2.23)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.5)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: r-api-3.5

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.8

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 3.5.2-1)

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

• dep: r-bioc-iranges

  conteneurs de bas niveau de GNU R de stockage de plages d’entiers

• dep: r-bioc-rsamtools

  importation de fichiers BAM, BCF et tabix pour GNU R

• dep: r-bioc-s4vectors

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-zlibbioc

  (Virtual) zlibbioc Bioconductor package

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Bibliothèque de compression - binaires

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
armhf	927,6 ko	5 369,0 ko	[liste des fichiers]