Paquet : kalign (1:3.3-1 et autres)
Liens pour kalign
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source kalign :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Charles Plessy (Page QA)
- Andreas Tille (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [msa.sbc.su.se]
Paquets similaires :
Alignement séquentiel multiple global et progressif
Kalign est un outil en ligne de commande pour l'alignement de séquences biologiques (ADN, ARN, proteïnes). Il utilise l'algorithme de concordance de chaînes Muth-Manber pour améliorer la précision et la vitesse de l'alignement. Il utilise une démarche d'alignement globale, progressive, enrichie par l'usage d'un algorithme de concordance de chaînes approché pour calculer les différences de séquence et par l'incorporation des correspondances locales dans tout autre alignement global.
Autres paquets associés à kalign
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libgomp1 (>= 6)
- bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)
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- enh: bioperl-run
- scripts d'enveloppe BioPerl
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- enh: t-coffee
- alignement multiple de séquences
Télécharger kalign
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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amd64 | 1:3.3-1+b3 | 133,4 ko | 1 144,0 ko | [liste des fichiers] |