Paketti: libssw0 (1.1-15 ja muut)

[ Source: libssw  ]

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.

Tagit: Role: Shared Library

Muut pakettiin libssw0 liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  GCC:n apukirjasto

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: zlib1g

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi libssw0

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
armel	1.1-15+b1	20.8 kt	60.0 kt	[tiedostoluettelo]