Tarkennettu haku
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ] [  experimental  ]

Source Package: cnvkit (0.9.10-3~0exp0)

Links for cnvkit

Debian-palvelut:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kokeellinen paketti

Varoitus: Tämä paketti on kokeellisesta jakelusta. Tämä tarkoittaa, että se on luultavasti epävakaa tai buginen, ja voi aiheuttaa jopa tiedonhäviötä. Kannattaa ehdottomasti tutustua muutoslokiin ja muihin mahdollisiin ohjeisiin ennen käyttöönottoa.

Seuraavat binääripaketit on käännetty tästä lähdepaketista:
cnvkit
Copy number variant detection from targeted DNA sequencing

Muut pakettiin cnvkit liittyvät paketit

  • build-depends
  • build-depends-indep
  • adep: debhelper-compat (= 13)
    Paketti ei saatavilla
  • adep: dh-sequence-python3
    Paketti ei saatavilla
  • adep: python3-all
    package depending on all supported Python 3 runtime versions
  • adep: python3-setuptools
    Python3 Distutils Enhancements
  • adep: pybuild-plugin-pyproject
    Debian helper tools for packaging Python libraries using PEP517
  • adep: python3-pytest
    Simple, powerful testing in Python3
  • adep: python3-pyfaidx
    efficient random access to fasta subsequences for Python 3
  • adep: python3-biopython
    Python3 library for bioinformatics
  • adep: python3-pandas
    data structures for "relational" or "labeled" data
  • adep: python3-numpy
    Python library for numerical computations (Python 3)
  • adep: python3-pysam
    interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
  • adep: python3-scipy
    scientific tools for Python 3
  • adep: python3-matplotlib
    Python based plotting system in a style similar to Matlab
  • adep: python3-pomegranate
    Fast, flexible and easy to use probabilistic modelling
  • adep: r-bioc-dnacopy (>= 1.78.0)
    R package: DNA copy number data analysis
  • adep: poppler-utils
    PDF utilities (based on Poppler)

Download cnvkit

TiedostoKoko (kt)MD5-tarkiste
cnvkit_0.9.10-3~0exp0.dsc 2.4 kt a972ab0601e5875fef47fac07f33125e
cnvkit_0.9.10.orig.tar.gz 23,108.4 kt ac1e8d636fc0fc694d1475a212d0cf98
cnvkit_0.9.10-3~0exp0.debian.tar.xz 17.3 kt d6423a6acc31aea516cf9f337be69c58
Debian Package Source Repository (VCS: Git)
https://salsa.debian.org/med-team/cnvkit.git
Debian Package Source Repository (Browsable)
https://salsa.debian.org/med-team/cnvkit