Paketti: pizzly (0.37.3+ds-9) [debports]
Links for pizzly
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti :
Ei löytynytYlläpitäjät:
External Resources:
- Kotisivu [github.com]
Samankaltaisia paketteja:
Identifies gene fusions in RNA sequencing data
For the interpretation of the transcriptome (the abundance and sequence of RNA) of tomour cells one is particularly interested in transcripts that cannot be mapped to single genes but that are seen to be fused as parts from two genes. Likely eplanations are chromosomal translocations.
Pizzly can identify novel such peculiarities, building on interpretations on variable splicing by the tool kallisto. Both tools are elements of the bcbio workflow.
Muut pakettiin pizzly liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: kallisto
- near-optimal RNA-Seq quantification
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4)
- GCC:n apukirjasto
-
- dep: libstdc++6 (>= 12.2.0-9)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
-
- rec: python3-h5py
- general-purpose Python interface to hdf5
Imuroi pizzly
Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|
alpha (epävirallinen siirros) | 271.7 kt | 1,059.0 kt | [tiedostoluettelo] |