Package: clustalx (2.1+lgpl-9 and others)

[ Source: clustalx  ]

Alineamiento múltiple de secuencias de ácidos nucleicos y proteínas (interfaz gráfica)

Este paquete ofrece una interfaz gráfica para el programa de alineación de secuencia múltiple Clustal. Proporciona un entorno integrado para realizar múltiples alineaciones de secuencia y de perfil y analizar los resultados. El alineamiento de secuencias se muestra en una ventana por pantalla. Posee un esquema de colores versátil para resaltar las características conservadas en la alineación. Para presentaciones profesionales, debe usarse el paquete LaTeX texshade o boxshade.

Los menús desplegables en la parte superior de la ventana permiten seleccionar todas las opciones necesarias para la secuencia múltiple tradicional y el perfil de la alineación. Puede cortar y pegar secuencias para cambiar el orden de la alineación; también puede seleccionar un subconjunto de secuencias a ser alineado; puede seleccionar un sub-rango de la alineación para ser realineado e insertado de nuevo en la alineación original.

Se puede realizar un análisis de la calidad de alineación y los segmentos con baja puntuación o residuos excepcionales pueden señalarse.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, User Interface: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Scope: Utility, Interface Toolkit: Lesstif/Motif, uitoolkit::qt, use::analysing, Purpose: Comparing, use::viewing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag, X Window System: Application

Other Packages Related to clustalx

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteca de C de GNU: Bibliotecas compartidas
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  Biblioteca de ayuda de GCC

• dep: libqt5core5t64 (>= 5.15.1)

  Qt 5 core module

• dep: libqt5gui5t64 (>= 5.2.0)

  Qt 5 GUI module

  or libqt5gui5-gles (>= 5.2.0)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5widgets5t64 (>= 5.0.2)

  Qt 5 widgets module

• dep: libqt5xml5t64 (>= 5.0.2)

  Qt 5 XML module

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  biblioteca estándar de C++ de GNU v3

• sug: boxshade

  impresión agradable de alineaciones de secuencias múltiples

• sug: clustalw

  global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

• sug: texlive-latex-extra

  TeX Live: LaTeX additional packages

Download clustalx

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
i386	2.1+lgpl-9+b1	474.3 kB	1,470.0 kB	[list of files]