Alineación de secuencias múltiples basada en segmentos
DIALIGN-TX es una aplicación basada en línea de comandos para realizar
alineamientos múltiples de proteínas o secuencias de ADN. Es una
re-implementación completa del enfoque fundamental que incluye nuevas
mejoras y heurísticas que mejoran significativamente la calidad de los
alineamientos de la salida, comparado con DIALIGN 2.2 y DIALIGN-T. Para el
alineamiento de pares, DIALIGN-TX usa un algoritmo «fragment-chaining» que
favorece cadenas de alineamientos locales de baja puntuación frente a los
fragmentos aislados de alta puntuación. Para alineamientos múltiples,
DIALIGN-TX emplea un procedimiento «greedy» mejorado que es menos sensible
a las falsas similitudes entre secuencias locales.
