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Resolutor adaptativo de Poisson Boltzmann

APBS es un paquete para la resolución numérica de ecuaciones de Poisson-Boltzmann (PBE), uno de los modelos continuos más populares para describir las interacciones electrostáticas entre solutos moleculares en medios salinos y acuosos. La electrostática continua juega un papel importante en varias áreas de la simulación biomolecular, incluyendo:

 * Simulación de procesos de difusión para determinar la cinética de los
   enlaces ligadura-proteína y proteína-proteína,
 * resolución implícita de la dinámica molecular de biomoléculas,
 * cálculo de disolución y energía de enlace para determinar las
   constantes de equilibrio de enlace ligadura-proteína y proteína-
   proteína y ayudar en el diseño racional de fármacos,
 * y estudio de valoraciones químicas biomoleculares.

APBS se diseñó para evaluar de forma eficiente las propiedades electrostáticas de tales simulaciones para un amplio rango de escalas de longitud con el fín de investigar moléculas con decenas de millones de átomos.

Tags: Field: Chemistry, Implemented in: C, User Interface: interface::commandline, role::program, Scope: Utility

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