Package: sra-toolkit (2.9.3+dfsg-1 and others)

[ Source: sra-sdk  ]

utilidades para el archivo de lectura de secuencia NCBI

Herramientas para leer el archivo SRA, generalmente mediante la conversión individual que funciona en algún formato utilizado comúnmente como fastq.

Los volcadores textuales "sra-dump" y "vdb-dump" se proporcionan en esta versión como ayuda en la inspección visual. Es probable que el formato de salida actual se cambie en un futuro próximo a una representación más estricta, más formalizada. POR FAVOR NO CONFIAR EN EL FORMATO DE SALIDA EN ESTA VERSIÓN.

Se mejorará la información de "ayuda" en próximas versiones futuras, y las opciones de la herramienta se estandarizaran en conjunto. También se proporcionará más documentación en el sitio de NCBI.

Las opciones de la herramienta pueden cambiar en la próxima versión. Las opciones de la herramienta de la versión 1 seguirán siendo compatibles siempre que sea posible a fin de preservar el funcionamiento de los guiones existentes.

Other Packages Related to sra-toolkit

• dep: libbz2-1.0

  biblioteca de compresión de archivos de alta calidad y ordenamiento de bloques, ejecutables

• dep: libc6 (>= 2.14)

  Biblioteca de C de GNU: Bibliotecas compartidas
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libfuse2 (>= 2.6)

  sistema de archivos en el espacio de usuario (biblioteca)

• dep: libhdf5-103

  Hierarchical Data Format 5 (HDF5) - runtime files - serial version

• dep: libkdf5-2

  hdf5 access to data in the INSDC Sequence Read Archives

• dep: libmagic1 (>= 5.12)

  detección del tipo de datos en un archivo usando números «mágicos» - biblioteca

• dep: libmbedcrypto3 (>= 2.13)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library

• dep: libmbedtls12 (>= 2.13)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library

• dep: libmbedx509-0 (>= 2.0)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - x509 certificate library

• dep: libncbi-vdb2

  libraries for using data in the INSDC Sequence Read Archives

• dep: libncbi-wvdb2

  virtual layer update modul of ncbi-vdb library

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  biblioteca estándar de C++ de GNU v3

• dep: libsz2

  Adaptive Entropy Coding library - SZIP

• dep: libxml2 (>= 2.6.27)

  biblioteca de XML de GNOME

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.2)

  Biblioteca de compresión, ejecutables

• rec: med-config (>= 2.1)

  Debian Med general config package

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	2.9.3+dfsg-1+b1	4,816.5 kB	9,306.0 kB	[list of files]