Package: mafft (7.475-1)

[ Source: mafft  ]

Programa de alineación múltiple para aminoácidos o secuencias de nucleótidos

MAFFT es un programa de alineación de secuencias múltiples que ofrece tres métodos orientados a la exactitud:

 * L-INS-i (probablemente el mas exacto, recomendado para secuencias <200;

método de refinamiento iterativo incorporando información de pares alineados locales),

 * G-INS-i (apropiado para secuencias de longitud similar, recomendado para

secuancias <200; método de refinamiento iterativo incorporando información de pares alineados globales),

 * E-INS-i (apropiado para secuencias que contienen grandes regiones no

alineables; recomendado para secuencias <200), y cinco métodos orientados a la rapidez:

 * FFT-NS-i (método de refinamiento iterativo; solo dos ciclos),
 * FFT-NS-i (método de refinamiento iterativo; máximo 1000 iteraciones),
 * FFT-NS-2 (rápido; método progresivo),
 * FFT-NS-1 (muy rápido, recomendado para secuencias >200; método

progresivo con un árbol guia aproximado),

 * NW-NS-PartTree-1 (recomendado para ~50,000 secuencias; método progresivo

con el algoritmo PartTree).

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Biological Sequence

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• rec: libwww-perl

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  Interpreter of object-oriented scripting language Ruby (default version)

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  Multiple Sequence Alignment

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