Package: exonerate (2.4.0-5)
Links for exonerate
Debian Resources:
Download Source Package exonerate:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Charles Plessy (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
External Resources:
- Homepage [www.ebi.ac.uk]
Similar packages:
Herramienta genérica para comparar secuencias de pares
Exonerate le permite alinear las secuencias usando muchos modelos de alineamiento, ya sea utilizando programación dinámica exhaustiva, o con una gran variedad de heurística. Gran parte de las funcionalidades de la suite de programación dinámica Wise se re-implementaron en C para una mayor eficiencia. Exonerate es un componente intrínseco de la construcción de las bases de datos del genoma de Ensembl, proporcionando coeficientes de similitud entre las secuencias del ANR y el ADN, permitiendo así determinar las uniones variables y las secuencias de la codificación en general.
Hay un sistema de simulación de experimentos «In-silico PCR» (consulte la página man ipcress) empaquetado con exonerate.
Este paquete también incluye una selección de utilidades para realizar manipulaciones sencillas y de forma rápida con archivos FASTA de más de 2Gb.
Other Packages Related to exonerate
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- Biblioteca de C de GNU: Bibliotecas compartidas
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libglib2.0-0 (>= 2.24.0)
- biblioteca GLib de rutinas C
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- sug: wise
- comparison of biopolymers, like DNA and protein sequences
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- enh: bioperl-run
- BioPerl wrappers: scripts
Download exonerate
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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mips64el | 1,430.4 kB | 9,143.0 kB | [list of files] |