Package: fastqc (0.11.9+dfsg-6)
Links for fastqc
Debian Resources:
Download Source Package fastqc:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Olivier Sallou (QA Page)
External Resources:
- Homepage [www.bioinformatics.babraham.ac.uk]
Similar packages:
control de calidad para datos de secuencias de alto rendimiento
El objetivo de FastQC es proporcionar una forma sencilla de realizar algunas comprobaciones de control de calidad de los datos de secuencia sin procesar procedentes de canales de secuenciación de alto rendimiento. Proporciona un conjunto modular de análisis que puede utilizar para obtener una impresión rápida sobre si sus datos tienen algún problema del que debería ser consciente antes de realizar cualquier análisis posterior.
Las principales funciones de FastQC son
* Importar datos desde archivos BAM, SAM o FastQ (cualquier variante) * Proporcionar una visión general rápida para informarle en qué áreaspuede haber problemas
* Gráficos y tablas de resumen para evaluar rápidamente sus datos * Exportar los resultados a un informe permanente basado en HTML * Operar fuera de línea para permitir la generación automática de informessin necesidad de ejecutar la aplicación interactiva.
Other Packages Related to fastqc
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- dep: default-jre
- Standard Java or Java compatible Runtime
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- dep: libcommons-math3-java
- Java lightweight mathematics and statistics components
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- dep: libfindbin-libs-perl
- Perl module to use a relative path for lib directories
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- dep: libhtsjdk-java
- Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats
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- dep: libjbzip2-java
- bzip2 compression/decompression library
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- dep: libsis-jhdf5-java
- easy-to-use HDF library for Java
Download fastqc
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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all | 380.8 kB | 563.0 kB | [list of files] |