Package: fastqc (0.11.9+dfsg-6)

Links for fastqc

Debian Resources:

Download Source Package fastqc:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Steffen Moeller (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)
Olivier Sallou (QA Page)

External Resources:

Homepage [www.bioinformatics.babraham.ac.uk]

Similar packages:

control de calidad para datos de secuencias de alto rendimiento

El objetivo de FastQC es proporcionar una forma sencilla de realizar algunas comprobaciones de control de calidad de los datos de secuencia sin procesar procedentes de canales de secuenciación de alto rendimiento. Proporciona un conjunto modular de análisis que puede utilizar para obtener una impresión rápida sobre si sus datos tienen algún problema del que debería ser consciente antes de realizar cualquier análisis posterior.

Las principales funciones de FastQC son

 * Importar datos desde archivos BAM, SAM o FastQ (cualquier variante)
 * Proporcionar una visión general rápida para informarle en qué áreas

puede haber problemas

 * Gráficos y tablas de resumen para evaluar rápidamente sus datos
 * Exportar los resultados a un informe permanente basado en HTML
 * Operar fuera de línea para permitir la generación automática de informes

sin necesidad de ejecutar la aplicación interactiva.

Tags: User Interface: Graphical User Interface, X Window System, Role: Program

Other Packages Related to fastqc

depends

recommends

suggests

enhances

dep: default-jre

Standard Java or Java compatible Runtime
dep: libcommons-math3-java

Java lightweight mathematics and statistics components
dep: libfindbin-libs-perl

Perl module to use a relative path for lib directories
dep: libhtsjdk-java

Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats
dep: libjbzip2-java

bzip2 compression/decompression library
dep: libsis-jhdf5-java

easy-to-use HDF library for Java

Download fastqc

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	380.8 kB	563.0 kB	[list of files]