Paket: r-bioc-deseq2 (1.44.0+dfsg-1)

[ Quellcode: r-bioc-deseq2  ]

R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis

Differential gene expression analysis based on the negative binomial distribution. Estimate variance-mean dependence in count data from high-throughput sequencing assays and test for differential expression based on a model using the negative binomial distribution.

Andere Pakete mit Bezug zu r-bioc-deseq2

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  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [nicht riscv64]

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  GCC Support-Bibliothek

• dep: liblapack3

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  oder liblapack.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

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• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

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• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1)

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  S4 Generic Summary Statistic Functions that Operate on Matrix-Like Objects

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• dep: r-cran-locfit

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• dep: r-cran-matrixstats

  GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix

• dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.0)

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• sug: r-bioc-glmgampoi (>= 1.16.0)

  GNU R fit a Gamma-Poisson generalized linear model

• sug: r-bioc-tximeta (>= 1.22.1)

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• sug: r-bioc-tximport (>= 1.32.0)

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• sug: r-bioc-tximportdata (>= 1.32.0)

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• sug: r-cran-biocmanager

  access the Bioconductor project package repository

• sug: r-cran-knitr

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• sug: r-cran-pbapply

  GNU R package providing progress bars for vectorized R functions

• sug: r-cran-pheatmap

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• sug: r-cran-rcolorbrewer

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• sug: r-cran-readr

  GNU R package to read rectangular text data

• sug: r-cran-rmarkdown

  Konvertierung von R-Markdown-Dokumenten in verschiedene Formate

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

r-bioc-deseq2 herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	1.253,3 kB	1.740,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.240,1 kB	1.752,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.243,4 kB	1.760,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.253,4 kB	1.816,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.251,0 kB	1.687,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.254,1 kB	1.748,0 kB	[Liste der Dateien]