Paket: r-bioc-deseq2 (1.44.0+dfsg-1)

[ Quellcode: r-bioc-deseq2  ]

R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis

Differential gene expression analysis based on the negative binomial distribution. Estimate variance-mean dependence in count data from high-throughput sequencing assays and test for differential expression based on a model using the negative binomial distribution.

Andere Pakete mit Bezug zu r-bioc-deseq2

• dep: libblas3

  Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek

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  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [nicht riscv64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: liblapack3

  Bibliothek von Routinen für Lineare Algebra (3) - gemeinsame Version

  oder liblapack.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

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  virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-bioc-biocgenerics

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• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel (>= 1.38.0)

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• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1)

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1)

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• dep: r-bioc-matrixgenerics (>= 1.16.0)

  S4 Generic Summary Statistic Functions that Operate on Matrix-Like Objects

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.34.0)

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• dep: r-cran-ggplot2 (>= 3.4.0)

  Implementierung der »Grammar of Graphics«

• dep: r-cran-locfit

  GNU R local regression, likelihood and density estimation

• dep: r-cran-matrixstats

  GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix

• dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.0)

  GNU-R-Paket für die nahtlose Verflechtung von R und C++

• dep: r-cran-rcpparmadillo

  GNU R package for Armadillo C++ linear algebra library

• sug: r-bioc-glmgampoi (>= 1.16.0)

  GNU R fit a Gamma-Poisson generalized linear model

• sug: r-bioc-tximeta (>= 1.22.1)

  Paket nicht verfügbar

• sug: r-bioc-tximport (>= 1.32.0)

  transcript-level estimates for biological sequencing

• sug: r-bioc-tximportdata (>= 1.32.0)

  GNU R various transcript abundance quantifiers

• sug: r-cran-biocmanager

  access the Bioconductor project package repository

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-pbapply

  GNU R package providing progress bars for vectorized R functions

• sug: r-cran-pheatmap

  GNU R package to create pretty heatmaps

• sug: r-cran-rcolorbrewer

  GNU R package providing suitable color palettes

• sug: r-cran-readr

  GNU R package to read rectangular text data

• sug: r-cran-rmarkdown

  Konvertierung von R-Markdown-Dokumenten in verschiedene Formate

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

r-bioc-deseq2 herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	1.253,3 kB	1.740,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.240,1 kB	1.752,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.243,4 kB	1.760,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.253,4 kB	1.816,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.251,0 kB	1.687,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.254,1 kB	1.748,0 kB	[Liste der Dateien]