Paket: bedtools (2.31.1+dfsg-2)

[ Quellcode: bedtools  ]

Hilfswerkzeugsammlung zum Vergleich genomischer Merkmale

Mit den Hilfswerkzeugen BEDTools können gewöhnliche genomische Aufgaben erledigt werden, etwa überlappende Merkmale und Berechnung der Abdeckung. Die Hilfswerkzeuge basieren großteils auf vier weit verbreiteten Dateiformaten: BED, GFF/GTF, VCF und SAM/BAM. Mit den BEDTools können ausgeklügelte Pipelines entwickelt werden, die komplizierte Forschungsfragen beantworten, indem verschiedene BEDTools zusammenarbeiten.

Das Dienstprogramm groupBy wird im Paket filo verteilt.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c++, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Suite, Zweck: use::analysing, use::comparing, Daten-Konvertierung, use::filtering, works-with::biological-sequence

Andere Pakete mit Bezug zu bedtools

• dep: libbz2-1.0

  Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Laufzeitbibliothek

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 7)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  Bibliothek für das XZ-Kompressionsformat

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
i386	727,9 kB	2.301,0 kB	[Liste der Dateien]