Quellcode-Paket: bioperl-run (1.7.3-6)
Links für bioperl-run
Debian-Ressourcen:
Betreuer:
Externe Ressourcen:
Andere Pakete mit Bezug zu bioperl-run
-
- adep:
debhelper-compat
(= 13)
- Paket nicht verfügbar
-
- idep:
perl
- Larry Wall's Practical Extraction und Report Language
-
- idep:
libmodule-build-perl
- Rahmenwerk zum Bau und zur Installation von Perl-Modulen
-
- idep:
bioperl
(>= 1.7.4)
- Perl-Werkzeuge für bioinformatische Anwendungen
-
- idep:
libalgorithm-diff-perl
- Modul für die Suche nach Unterschieden zwischen Dateien
-
- idep:
libipc-run-perl
- Perl-Modul für laufende Prozesse
-
- idep:
libio-string-perl
- Emuliert die IO::File-Schnittstelle für »in-core«-Zeichenketten
-
- idep:
libxml-twig-perl
- Perl-Modul für baumartigen Zugriff auf XML-Dateien
-
- idep:
libfile-sort-perl
- module to sort a file or merge sort multiple files
-
- idep:
libtest-most-perl
- Perl module with the most commonly needed test functions and features
-
- idep:
libarray-compare-perl
- Perl module to easily compare arrays
-
- idep:
libtree-dagnode-perl
- Perl-Basisklasse zur Repräsentation von Knoten in einer Baumstruktur
-
- idep:
libbio-cluster-perl
- BioPerl cluster modules
-
- idep:
libbio-featureio-perl
- Modules for reading, writing, and manipulating sequence features
-
- idep:
libconfig-any-perl
- Modul zum Laden von Konfigurationen von unterschiedlichen Dateiformaten
-
- idep:
libbio-tools-run-alignment-clustalw-perl
- Bioperl interface to Clustal W
-
- idep:
libbio-eutilities-perl
- BioPerl interface to the Entrez Programming Utilities (E-utilities)
-
- idep:
libbio-tools-run-remoteblast-perl
- Object for remote execution of the NCBI Blast via HTTP
-
- idep:
amap-align
- Protein multiple alignment by sequence annealing
-
- idep:
bedtools
- Hilfswerkzeugsammlung zum Vergleich genomischer Merkmale
-
- idep:
bedtools-test
- test data for the bedtools package
-
- idep:
ncbi-blast+-legacy
- NCBI Blast legacy call script
-
- idep:
clustalw
- Globale multiple Alignments von Nukleotid- oder Peptidsequenzen
-
- idep:
emboss
- Europäische, quelloffene Software-Suite für Molekularbiologie
-
- idep:
exonerate
- Generisches Werkzeug zum paarweisen Sequenzvergleich
-
- idep:
hmmer
[any-amd64 any-i386 powerpc ppc64]
- Profil-Hidden-Markov-Modelle für Protein-Sequenzanalyse
-
- idep:
hyphy-pt
- Hypothesentest unter Verwendung von Phylogenie (pthreads-Version)
- oder
hyphy-mpi
- Hypothesentest unter Verwendung von Phylogenie (MPI-Version)
-
- idep:
infernal
[any-amd64 any-i386]
- Rückschluss auf Alignments der RNA-Sekundärstruktur
-
- idep:
kalign
- Globales und fortschreitendes multiples Sequenzalignment
-
- idep:
mafft
- Programm für multiples Alignment von Aminosäure- oder Nukleotidsequenzen
-
- idep:
muscle
- Programm zur Ausrichtung mehrerer Proteinsequenzen
-
- idep:
ncoils
- coiled coil secondary structure prediction
-
- idep:
phyml
- Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood
-
- idep:
primer3
- tool to design flanking oligo nucleotides for DNA amplification
-
- idep:
probcons
- PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment
-
- idep:
python3-pybedtools
- Python 3 wrapper around BEDTools for bioinformatics work
-
- idep:
raxml
- Randomized Axelerated Maximum Likelihood of phylogenetic trees
-
- idep:
samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- idep:
sim4
- Werkzeug für Alignments von cDNA mit genomischer DNA
-
- idep:
tigr-glimmer
- Generkennung in Genomen von Bakterien und Archaebakterien
-
- idep:
wise
- Vergleich biologischer Polymere, wie DNA- und Protein-Sequenzen
-
- idep:
fasttree
- phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences
-
- idep:
lagan
- highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner
-
- idep:
pal2nal
- converts proteins to genomic DNA alignment
-
- idep:
pftools
[any-amd64]
- build and search protein and DNA generalized profiles
-
- idep:
libwww-perl
- Einfache und konsistente Schnittstelle zum World Wide Web
