Paket: clustalw (2.1+lgpl-7) [debports]
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Externe Ressourcen:
- Homepage [www.clustal.org]
Ähnliche Pakete:
Globale multiple Alignments von Nukleotid- oder Peptidsequenzen
Clustal W führt ein Alignment mehrerer Nukleotid- oder Aminosäurensequenzen aus. Das Programm erkennt das Format der Eingabesequenzen und ob die Sequenzen aus Nuklein- (DNA/RNA) oder Aminosäuren (Proteine) bestehen. Das Ausgabeformat kann aus verschiedenen Formaten für multiple Alignments ausgewählt werden, etwa Phylip oder FASTA. Clustal W ist allgemein anerkannt.
Die Ausgabe von Clustal W kann händisch editiert werden, jedoch wird ein Alignment-Editor wie SeaView oder Clustal X empfohlen. Bei der Erstellung eines Modells aus Ihrem Alignment, kann die Ausgabe für verbesserte Datenbanksuchen verwendet werden. Das Debian-Paket hmmer erstellt dies mittels eines Hidden-Markov-Modells (HMM).
Andere Pakete mit Bezug zu clustalw
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.4)
- GCC Support-Bibliothek
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
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- sug: clustalx
- Multiples Alignment von Nukleotid- und Proteinsequenzen (grafische Oberfläche)
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- sug: seaview
- Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny
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- enh: bioperl-run
- BioPerl-Hüllen: Skripte
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- enh: emboss
- Europäische, quelloffene Software-Suite für Molekularbiologie
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- enh: t-coffee
- Multiple Sequence Alignment
clustalw herunterladen
Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
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sparc64 (inoffizielle Portierung) | 231,2 kB | 747,0 kB | [Liste der Dateien] |