Paket: lagan (2.0-10) [debports]

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Homepage [lagan.stanford.edu]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

Andere Pakete mit Bezug zu lagan

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1)

GCC Support-Bibliothek
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
hppa (inoffizielle Portierung)	174,6 kB	716,0 kB	[Liste der Dateien]