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Paket: gwama (2.2.2+dfsg-5)

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Metaanalysen für genomweite Assoziationen

Die Software GWAMA (Genome-Wide Association Meta Analysis) führt Metaanalysen der Resultate von genomweiten Assoziationsstudien (GWAS) binärer oder quantitativer Phänotypen durch. Fixed- und Random-Effect-Metaanalysen werden sowohl für direkt genotypisierte als auch zugerechnete SNPs durchgeführt. Dabei werden Schätzungen des Verhältnisses der Allel-Wahrscheinlichkeiten und ein 95%-Konfidenzintervall für binäre Eigenschaften sowie Schätzungen der Größe von Allel-Effekten und Standardfehlern für quantitative Phänotypen verwendet. GWAMA kann für die Analyse von Resultaten aller unterschiedlichen genetischen Modelle (multiplikativ, additiv, dominant, rezessiv) verwendet werden. Die Software beinhaltet Möglichkeiten zur Ausnahmebehandlung, um Fehler in der Strangausrichtung und »allele flipping« zu entdecken, sowie um Tests zur Heterogenität von Effekten zwischen Studien durchzuführen.

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