Paket: r-bioc-edger (4.4.1+dfsg-1)

[ Quellcode: r-bioc-edger  ]

Experimentelles Paket

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Empirische Analyse von digitalen Genexpressionsdaten mit R

Bioconductor-Paket zur Differentialexpressionsanalyse eines vollkommen sequenzierten Transkriptom (RNA-seq) und digitalen Genexpressionsprofilen mit biologischer Replikation. Es verwendet empirische Bayes-Methoden und exakte Tests, die auf der negativen Binomialverteilung basieren. Es ist auch für die Differentialsignalanalyse mit anderen Typen von Zähldaten in der Größenordnung von Genomen verwendbar.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::r, interface::commandline, Rolle: Programm

Andere Pakete mit Bezug zu r-bioc-edger

• dep: libblas3

  Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek

  oder libblas.so.3

  Paket nicht verfügbar

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [nicht riscv64]

• dep: liblapack3

  Bibliothek von Routinen für Lineare Algebra (3) - gemeinsame Version

  oder liblapack.so.3

  Paket nicht verfügbar

• dep: r-api-4.0

  Paket nicht verfügbar

• dep: r-api-bioc-3.20

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-limma (>= 3.61.9)

  linear models for microarray data

• dep: r-cran-locfit

  GNU R local regression, likelihood and density estimation

• sug: r-bioc-annotationdbi

  GNU R Annotation Database Interface for BioConductor

• sug: r-bioc-biobase

  base functions for Bioconductor

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-org.hs.eg.db

  genome-wide annotation for Human

• sug: r-bioc-rhdf5

  BioConductor HDF5 interface to R

• sug: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor assay container

• sug: r-cran-jsonlite

  Robust, High Performance JSON Parser and Generator for R

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-matrix

  GNU R - Paket von Klassen für dicht und dünn besetzte Matrizen

• sug: r-cran-readr

  GNU R package to read rectangular text data

• sug: r-cran-seuratobject

  GNU R data structures for single cell data

r-bioc-edger herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	1.090,2 kB	1.317,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.087,4 kB	1.333,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.086,5 kB	1.337,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.093,8 kB	1.397,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.095,3 kB	1.333,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.090,9 kB	1.297,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.093,7 kB	1.321,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.083,6 kB	2.232,0 kB	[Liste der Dateien]