Paket: blasr (5.3.2+dfsg-1.1)

[ Quellcode: blasr  ]

mapping single-molecule sequencing reads

Basic local alignment with successive refinement (BLASR) is a method for mapping single-molecule sequencing reads against a reference genome. Such reads are thousands of bases long, with divergence between them and the genome being dominated by insertion and deletion error.

Andere Pakete mit Bezug zu blasr

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libhdf5-cpp-103 (>= 1.10.1)

  Hierarchisches Datenformat 5 (HDF5) - C++-Bibliotheken

• dep: libpbbam0.19.0 (>= 0.19.0+dfsg)

  Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library

• dep: libpbseq (>= 0~20160912)

  library for analyzing PacBio sequencing data

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	207,3 kB	633,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	184,5 kB	565,0 kB	[Liste der Dateien]