Paket: r-bioc-rsamtools (2.6.0-1)

[ Quellcode: r-bioc-rsamtools  ]

GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import

This package provides an interface to the 'samtools', 'bcftools', and 'tabix' utilities for manipulating SAM (Sequence Alignment / Map), binary variant call (BCF) and compressed indexed tab-delimited (tabix) files.

Andere Pakete mit Bezug zu r-bioc-rsamtools

• dep: libc6 (>= 2.15) [nicht arm64, ppc64el]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

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  Einfach nutzbare Client-Bibliothek für URL-Übertragungen (OpenSSL-Variante)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, i386, mipsel]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

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  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

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  virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.12

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)

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  generic functions for Bioconductor

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  BioConductor facilities for parallel evaluation

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  GNU R string objects representing biological sequences

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.1.3)

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• dep: r-bioc-rhtslib (>= 1.17.7)

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• dep: r-bioc-xvector (>= 0.19.7)

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• dep: r-bioc-zlibbioc

  (Virtual) zlibbioc Bioconductor package

• dep: r-cran-bitops

  GNU R package implementing bitwise operations

• rec: r-bioc-shortread

  GNU R classes and methods for high-throughput short-read sequencing data

• rec: r-cran-runit

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• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-genomicalignments

  BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	3.573,5 kB	5.515,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	3.540,4 kB	5.471,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	3.509,2 kB	5.372,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	3.517,2 kB	5.168,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	3.603,3 kB	5.603,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	3.539,3 kB	5.636,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	3.542,2 kB	5.575,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	3.609,6 kB	5.847,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	3.543,7 kB	5.583,0 kB	[Liste der Dateien]