Paket: miniasm (0.3+dfsg-2)
Links für miniasm
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket miniasm herunterladen:
Betreuer:
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads
Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.
Andere Pakete mit Bezug zu miniasm
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.4) [nicht amd64, arm64, ppc64el]
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Kompressions-Bibliothek - Laufzeit
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- rec: minimap
- tool for approximate mapping of long biosequences such as DNA reads
miniasm herunterladen
Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
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amd64 | 29,6 kB | 70,0 kB | [Liste der Dateien] |
arm64 | 27,8 kB | 66,0 kB | [Liste der Dateien] |
armel | 28,3 kB | 66,0 kB | [Liste der Dateien] |
armhf | 26,8 kB | 54,0 kB | [Liste der Dateien] |
i386 | 31,9 kB | 74,0 kB | [Liste der Dateien] |
mips64el | 30,4 kB | 78,0 kB | [Liste der Dateien] |
mipsel | 30,0 kB | 77,0 kB | [Liste der Dateien] |
ppc64el | 32,6 kB | 83,0 kB | [Liste der Dateien] |
s390x | 28,5 kB | 74,0 kB | [Liste der Dateien] |