Paket: beagle (5.1-200518+dfsg-1)

[ Quellcode: beagle  ]

Genotype calling, genotype phasing and imputation of ungenotyped markers

Beagle performs genotype calling, genotype phasing, imputation of ungenotyped markers, and identity-by-descent segment detection. Genotypic imputation works on phased haplotypes using a Li and Stephens haplotype frequency model. Beagle also implements the Refined IBD algorithm for detecting homozygosity-by-descent (HBD) and identity-by-descent (IBD) segments.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::java, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Analyse

Andere Pakete mit Bezug zu beagle

• dep: default-jre

  Standard-Java- oder Java-kompatible Laufzeitumgebung

  oder java11-runtime

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch default-jre, openjdk-11-jre, openjdk-17-jre

• dep: libhtsjdk-java

  Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats

• sug: beagle-doc

  Documentation for Beagle

beagle herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
all	298,5 kB	622,0 kB	[Liste der Dateien]