Package: mapdamage (2.2.2+dfsg-1)

[ Source: mapdamage  ]

Registrering og kvantificering af skademønstre i ældre DNA-sekvenser

MapDamage er en beregningsramme skrevet i Python og R, der registrerer og kvantificerer DNA-skademønstre blandt ældre DNA-sekventeringslæsnigner oprettet af Next-Generation Sequencing-platforme.

MapDamage er udviklet af Centre for GeoGenetic af Orlandogruppen.

Other Packages Related to mapdamage

• dep: libopenblas-dev

  Optimeret BLAS-bibliotek - lineær algebra (udv., meta)

  or libblas-dev

  Basic Linear Algebra Subroutines 3, statisk bibliotek

  or libatlas-base-dev

  Package not available

  or libblas.so

  virtual package provided by libblas-dev, libblis-openmp-dev, libblis-pthread-dev, libblis-serial-dev, libopenblas-openmp-dev, libopenblas-pthread-dev, libopenblas-serial-dev

• dep: libopenblas-dev

  Optimeret BLAS-bibliotek - lineær algebra (udv., meta)

  or liblapack-dev

  Bibliotek for lineære algebrarutiner 3 - statisk version

  or libatlas-base-dev

  Package not available

  or liblapack.so

  virtual package provided by liblapack-dev, libopenblas-openmp-dev, libopenblas-pthread-dev, libopenblas-serial-dev

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• dep: python3-pysam

  Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3

• dep: r-base-core

  GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem

• dep: r-cran-gam

  Generalized Additive Models for R

• dep: r-cran-ggplot2

  Implementering af Grammar of Graphics

• dep: r-cran-inline

  GNU R-pakke til indlejret C, C++, Fortran-funktioner fra R

• dep: r-cran-rcpp

  GNU R-pakke for Seamless R og C++-integration

• dep: r-cran-rcppgsl

  GNU R package for integration with the GNU GSL

• dep: seqtk

  Hurtigt letvægtsværktøj til behandling af sekvenser i formaterne FASTA eller FASTQ

Download mapdamage

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	41.1 kB	192.0 kB	[list of files]