Package: spaced (1.2.0-201605+dfsg-4 and others)

[ Source: spaced  ]

Justeringsfri sekvenssammenligning ved hjælp af afskårne ord

Spaced (Words) er en ny tilgang til justeringsfri sekvenssammenligning. Mens de fleste justeringsfrie algoritmer sammenligner ord-sammensætning af sekvenser bruger Spaced et mønster af gælder og gælder ikke stillinger. Forekomsten af et mellemrum i en sekvens defineres derefter kun af tegnene i matchpositionerne, mens tegnene på positionerne gælder ikke ignoreres. I stedet for sammenligning af frekvenserne af sammenhængende ord i indgangssekvenserne, denne nye fremgangsmåde sammenligner frekvenserne af de adskilte ord i overensstemmelse med det foruddefinerede mønster. En informations-teoretisk afstandsmåling bruges til at definere parvise afstande på sæt af indgangssekvenser baseret på deres mellemrumsordfrekvenser. Systematisk test kørt på ægte og simulerede sekvenssæt har vist, at for fylogenirekonstruktion, er denne fremgangsmåde med flere mellemrum-ord langt bedre end den klassiske justeringsfri tilgang baseret på sammenhængende ordfrekvenser.

Other Packages Related to spaced

• dep: libc6 (>= 2.34) [not arm64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, riscv64]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgomp1 (>= 9)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

Download spaced

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1.2.0-201605+dfsg-4	59.4 kB	168.0 kB	[list of files]
arm64	1.2.0-201605+dfsg-4+b1	54.6 kB	153.0 kB	[list of files]
armel	1.2.0-201605+dfsg-4	53.0 kB	151.0 kB	[list of files]
armhf	1.2.0-201605+dfsg-4	51.9 kB	111.0 kB	[list of files]
i386	1.2.0-201605+dfsg-4	66.2 kB	179.0 kB	[list of files]
mips64el	1.2.0-201605+dfsg-4	58.6 kB	223.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.2.0-201605+dfsg-4	62.0 kB	216.0 kB	[list of files]
riscv64	1.2.0-201605+dfsg-4	57.7 kB	128.0 kB	[list of files]
s390x	1.2.0-201605+dfsg-4	61.9 kB	180.0 kB	[list of files]