Package: velvet-tests (1.2.10+dfsg1-9)

[ Source: velvet  ]

Testdata for sekvensassembleren Velvet

Velvet er en »de novo«-genomisk assembler som er specielt designet for teknologier til kort læsning, såsom Solexa eller 454, udviklet af Daniel Zerbino og Ewan Birney ved European Bioinformatics Institue (EMBL-EBI), nær Cambridge, i Storbritannien.

Velvet kan i øjeblikket tage korte læsesekvenser, fjerner fejl og fremstiller dernæst unikke »contig'er« i høj kvalitet. Det anvender derefter parvis læseinformation, hvis tilgængelig, til at indhente de gentagne områder mellem contig'erne.

Denne pakke indeholder testdataene til at køre enhedstest for Velvet, en de novo genomisk assembler, som kan bruges som et yderligere sæt af eksempler.

Other Packages Related to velvet-tests

• rec: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

Download velvet-tests

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	10,496.8 kB	10,521.0 kB	[list of files]