Package: cat-bat (5.3-2)

[ Source: cat-bat  ]

Taksonomisk klassifikation af contigs og metagenom-samlede genomer (MAG'er)

Contig Annotation Tool (CAT) og Bin Annotation Tool (BAT) der datakanaler for taksonomisk klassifikation af lange DNA-sekvenser og metagenom-samlede genomer (MAG'er/bin'er) for både kendte og (meget) ukendte mikroorganismer, som oprettet af moderne metagenomstudier. Grundalgoritmen for begge programmer involverer gen-kald, oversættelse af forudsagte ORF'er mod nr protein-databasen og stemmebaseret klassifikation af hele contig'en/MAG'en baseret på klassifikation af de individuelle ORF'er. CAT og BAT kan afvikles fra mellemliggende trin, hvis filerne er korrekt formateret.

Other Packages Related to cat-bat

• dep: diamond-aligner

  Accelereret BLAST-kompatibel lokal sekvenssammenligner

• dep: prodigal

  Mikrobiel (bakteriel og archaeorganisme) genkonstateringsprogram

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

Download cat-bat

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
s390x	38.5 kB	199.0 kB	[list of files]