Package: brig (0.95+dfsg-3)

[ Source: brig  ]

BLAST Ring Image Generator

BRIG kan vise cirkulære sammenligninger mellem et stort antal genomer, med fokus på håndtering af genommontagedata.

 * Billederne viser ligheden mellem en central henvisningssekvens og andre
   sekvenser som koncentriske ringe.
 * BRIG vil udføre alle BLAST-sammenligninger og filfortolkninger
   automatisk via en simpel grafisk brugerflade.
 * Contig-grænser og læs-dækning kan vises for udkastgenomer;
   tilpassede grafer og kommentarer kan vises.
 * Ved hjælp af en brugerdefineret sæt af gener som inddata, kan BRIG vise
   gentilstedeværelse, fravær, afkortning eller variationssekvens i et sæt
   af komplette genomer, udkastgenomer eller endda rå, ikke samlede
   sekvensdata.
 * BRIG accepterer også SAM-formaterede read-mapping-filer, der gør det
   muligt at genomiske regioner i usamlede sekvensdata fra flere prøver
   kan sammenlignes samtidigt

Other Packages Related to brig

• dep: cgview

  Cirkulær genomfremviser

• dep: default-jre

  Standardjava eller Javakompatibel kørselstid

  or java6-runtime

  virtual package provided by default-jre, openjdk-17-jre, openjdk-21-jre

  or java7-runtime

  virtual package provided by default-jre, openjdk-17-jre, openjdk-21-jre

  or java8-runtime

  virtual package provided by default-jre, openjdk-17-jre, openjdk-21-jre

  or java9-runtime

  virtual package provided by default-jre, openjdk-17-jre, openjdk-21-jre

  or java10-runtime

  virtual package provided by default-jre, openjdk-17-jre, openjdk-21-jre

  or java11-runtime

  virtual package provided by default-jre, openjdk-17-jre, openjdk-21-jre

• dep: jarwrapper (>= 0.5)

  Kør kørbare Java .jar-filer

• dep: libjdom1-java

  lightweight and fast library using XML

• dep: libswing-layout-java

  Extensions to Swing layout

Download brig

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
s390x	112.0 kB	412.0 kB	[list of files]