Package: boxshade (3.3.1-14 and others)

[ Source: boxshade  ]

Pæn udskrift af flere sekvensersammenstillinger

Boxshade er et program til at lave flotte udskrifter fra flere protein- eller DNA-sekvensersammenstillinger. Programmet udfører ikke selv sammenstillingerne og kræver som inddata en fil, som er oprettet af et program til sekvenssammenstilling eller manuelt redigeret med respektive værktøjer.

Boxshade læser flere sekvenssammenstillinger fra PILEUP-MSF, CLUSTAL- ALN, MALIGNED-data og ESEE-save filer (begrænset til et maksimum af 150 sekvenser med op til 10000 elementer i hver). Adskillige slags skygger kan påføres på identitiske/lignende restkoncentrationer. Uddata skrives til skærm eller til en fil i følgende formater: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, use::typesetting, Supports Format: works-with-format::html, works-with-format::plaintext, works-with-format::postscript, works-with-format::tex, Works with: Need an extra tag, Text

Other Packages Related to boxshade

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• sug: kalign

  Global og progressiv flersekvensjustering

  or clustalw

  Global nukleotid eller peptid sekvensjustering

  or mafft

  Program til justering af flere aminosyrer eller nukleotide sekvenser

  or hmmer

  Profilskjulte Markov-modeller for proteinsekvensanalyse

• sug: seaview

  Grænseflade til flere platforme for sekvenssammenligning og fylogeni

• sug: texlive-latex-extra

  Tex Live - yderligere LaTeX-pakker

• sug: xfig

  Interaktiv tegning af figurer under X11

Download boxshade

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
riscv64	3.3.1-14+b2	52.7 kB	152.0 kB	[list of files]