Package: rapmap (0.15.0+dfsg-4 and others)

[ Source: rapmap  ]

Hurtig sensitiv og præcis DNA-læsningsoversættelse via quasi-mapping

RapMap er et testområde for ideer i quasi-mapping / (simpel/pseudo) transkriptom-sammenligning. Dette betyder, at på dette tidspunkt, så er programmet lidt eksperimentelt. Udviklingsgrenen vil have de seneste forbedringer og tilføjelser, men er ikke garanteret til at være stabil mellem indsendelser. Manglende kompatibilitet med master-grenen vil blive fulgt af et mærke til versionen før kompatibilitetsbruddet. I øjeblikket er RapMap en uafhængig quasi-mapper, der kan bruges med andre værktøjer. Bruges også som en del af Sailfish og Salmon. Eventuelt er håbet at oprette og stabilisere en API, så det kan bruges som et bibliotek fra andre værktøjer.

Quasi-mapping-sammenligning (simpel/pseudo) er termen, der bruges her for typen af information krævet for bestemte opgaver (f.eks. transkript-kvantifikation), der er mindre »tung« end den tilbudt af den traditionelle sammenligning.

Other Packages Related to rapmap

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

  Hurtig suffiks-tabelkonstruktion

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  GCC støttebibliotek

• dep: libjemalloc2 (>= 5.0.0)

  skalerbar og samtidig malloc(3)-implementering for mange formål

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download rapmap

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	0.15.0+dfsg-4+b2	865.7 kB	3,125.0 kB	[list of files]