Package: python3-unifrac (1.3-4)

[ Source: unifrac  ]

Højtydende fylogenetisk mangfoldighedsberegninger

De facto-arkivet for højtydende fylogenetiske mangfoldighedsberegninger. Metoderne i dette arkiv er baseret på en implementering af Strided State UniFrac-algoritmen der er hurtigere, og bruger mindre hukommelse end Fast UniFrac. Strided State UniFrac understøtter Unweighted UniFrac, Weighted UniFrac, Generalized UniFrac, Variance Adjusted UniFrac og meta UniFrac. Dette arkiver indeholder også Stacked Faith (manuskript under forberedelse), en metode til at beregne Faith's PD, der er hurtigere og bruger mindre hukommelse end den Fast UniFrac-baserede referenceimplementering.

Denne pakke indeholder Python 3-modulet.

Other Packages Related to python3-unifrac

• dep: libc6 (>= 2.17)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libssu0 (>= 1.4)

  Højtydende fylogenetisk mangfoldighedsberegninger - bibliotek

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.12~)

• dep: python3-biom-format

  Biological Observation Matrix-format (BIOM) - Python 3

• dep: python3-h5py (>= 3.3.0)

  Almene Pythongrænseflader til hdf5

• dep: python3-iow

  Balanceret parentheses-træstruktur

• dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)

  Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget

• dep: python3-numpy-abi9

  virtual package provided by python3-numpy

• dep: python3-skbio (>= 0.6.1)

  Python3-datastrukturer, algoritmer, undervisningsressourcer for bioinformatik

Download python3-unifrac

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
ppc64el	143.6 kB	748.0 kB	[list of files]