Package: r-bioc-gsva (1.52.3+ds-1)
Links for r-bioc-gsva
Debian Resources:
Download Source Package r-bioc-gsva:
- [r-bioc-gsva_1.52.3+ds-1.dsc]
- [r-bioc-gsva_1.52.3+ds.orig.tar.xz]
- [r-bioc-gsva_1.52.3+ds-1.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [bioconductor.org]
Similar packages:
Gene Set Variation Analysis for microarray og RNA-seq-data
Gene Set Variation Analysis (GSVA) er en uden parametre, ikke overvåget metode til at estimere variation for gensætberigelse via prøverne i et udtryksdatasæt. GSVA udfører en ændring i koordinatsystemer, transformerer dataene fra et gen via prøvematrix til et gensæt efter prøvematrix, der dermed tillader evalueringen af pathway-berigelse for hver prøve. Denne nye matrix med GSVA-berigelsesbedømmelser faciliterer anvendelse af analytiske metoder såsom funktionel berigelse, overlevelsesanalyse, klyngeopbygning, CNV-pathway-analyse eller cross-tissue pathway-analyse, på en pathway-centrisk måde.
Other Packages Related to r-bioc-gsva
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.4)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: r-api-4.0
- virtual package provided by r-base-core
-
- dep: r-api-bioc-3.19
- virtual package provided by r-bioc-biocgenerics
-
- dep: r-bioc-biobase (>= 2.64.0)
- Grundlæggende funktioner for Bioconductor
-
- dep: r-bioc-biocparallel (>= 1.38.0)
- BioConductor - faciliteter for parallel evulering
-
- dep: r-bioc-biocsingular (>= 1.20.0)
- Singular Value Decomposition for Bioconductor Packages
-
- dep: r-bioc-delayedarray (>= 0.30.1)
- BioConductor delayed operations on array-like objects
-
- dep: r-bioc-delayedmatrixstats (>= 1.26.0)
- Functions on Rows and Columns of 'DelayedMatrix' Objects
-
- dep: r-bioc-gseabase (>= 1.66.0)
- Gene Set Enrichment Analysis - datastrukturer og metoder
-
- dep: r-bioc-hdf5array (>= 1.32.0)
- HDF5 backend for DelayedArray objects
-
- dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1)
- GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller
-
- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)
- BioConductor S4-implementering af vektorer og lister
-
- dep: r-bioc-singlecellexperiment (>= 1.26.0)
- S4 Classes for Single Cell Data
-
- dep: r-bioc-sparsematrixstats (>= 1.16.0)
- Bioconductor - resumestatistik for rækker og kolonner for rumlige tabeller
-
- dep: r-bioc-spatialexperiment (>= 1.14.0)
- S4 Class for Spatially Resolved -omics Data
-
- dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.34.0)
- BioConductor - assay-container
-
- dep: r-cran-matrix (>= 1.5-0)
- GNU R-pakke til klasser for tætte matricer og matricer med få udfald
-
- sug: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)
- Generiske funktioner for Bioconductor
-
- sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1)
- Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter
-
- sug: r-bioc-edger (>= 4.2.0)
- Empirisk analyse af digitale gen-udtryksdata i R
-
- sug: r-bioc-genefilter (>= 1.86.0)
- Metoder for filtrering af gener fra microarray-eksperimenter
-
- sug: r-bioc-gsvadata (>= 1.40.0)
- Data employed in the vignette of the GSVA package
-
- sug: r-bioc-limma (>= 3.60.3)
- Lineære modeller for microarray-data
-
- sug: r-bioc-org.hs.eg.db (>= 3.19.1-1)
- Genom-bred annotation for mennesker
-
- sug: r-cran-data.table
- GNU R-udvidelse af Data.frame
-
- sug: r-cran-future
- R-pakke - en fremtidig API for R
-
- sug: r-cran-ggplot2
- Implementering af Grammar of Graphics
-
- sug: r-cran-knitr
- GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming
-
- sug: r-cran-plotly
- Opret interaktiv internetgrafik via »plotly.js« i GNU R
-
- sug: r-cran-promises
- GNU R abstractions for promise-based asynchronous programming
-
- sug: r-cran-rcolorbrewer
- GNU R-pakke der tilbyder egnede farvepaletter
-
- sug: r-cran-rmarkdown
- convert R markdown documents into a variety of formats
-
- sug: r-cran-runit
- GNU R-pakke der tilbyder en ramme for enhedstest
-
- sug: r-cran-shiny
- GNU R-internetprogramramme
-
- sug: r-cran-shinydashboard
- GNU R-opret instrumentbræt med »Shiny«
-
- sug: r-cran-shinyjs
- Forbedr nemt brugeroplevelsen for dine Shiny-programmer på sekunder
Download r-bioc-gsva
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
mips64el | 1,088.2 kB | 1,366.0 kB | [list of files] |