Package: ncbi-entrez-direct (19.2.20230331+dfsg-3 and others)

[ Source: ncbi-entrez-direct  ]

NCBI Entrez-redskaber på kommandolinjen

Entrez Direct (EDirect) er en avanceret metode til at tilgå NCBI's sæt af forbundne databaser (udgivelse, sekvens, struktur, gen, variation, udtryk etc.) fra et terminalvindue eller et skript. Funktioner anvender søgetermer fra kommandolinjeargumenter. Individuelle operationer kombineres til at bygge forespørgsler i flere trin. Postindhentelse og formatering fuldender normalt processen.

EDirect tilbyder også en funktion drevet af argumenter, der forenkler udtrækningen af data fra dokumentresume eller andre resultater, der returneres i struktureret XML-format. Dette kan eliminere behovet for at skrive tilpassede programmer for at besvare ad hoc-spørgsmål. Forespørgsler kan flytte problemfrit mellem EDirect-kommandoer og UNIX-redskaber eller skripter for at udføre handlinger, der ikke kan opnås helt i Entrez.

Other Packages Related to ncbi-entrez-direct

• dep: curl

  Kommandolinjeværktøj for overførsel af data med adressesyntaks

  or wget

  Henter filer fra nettet

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• rec: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• sug: curl

  Kommandolinjeværktøj for overførsel af data med adressesyntaks

• sug: libxml-simple-perl

  Perlmodul for læsning og skrivning af XML

• sug: libxml2-utils

  GNOME XML-bibliotek - redskaber

• sug: perl

  Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

• sug: unzip

  Udpakningsprogram til .zip-filer

Download ncbi-entrez-direct

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
mips64el	19.2.20230331+dfsg-3+b3	5,436.6 kB	29,692.0 kB	[list of files]