Package: libvcflib-tools (1.0.9+dfsg1-3 and others)

[ Source: libvcflib  ]

C++-bibliotek til at fortolke og manipulere VCF-filer - værktøjer

Variant Call Format (VCF) er en flad fil, indryk afgrænser tekstformatet, lavet til præcist at beskrive referenceindekserede variationer mellem individer. VCF tilbyder et fælles udvekslingsformat for beskrivelsen af variation i individer og befolkninger, og har nogle standardformater til rapportering for en bred vifte af registreringsprogrammer til genvarianter.

Vcflib tilbyder metoder til at manipulere og fortolke sekvensvariation som det er beskrevet af VCF. Det er både:

 * en API til at fortolke og arbejde på poster med genvariation, som
   det kan beskrives af VCF-formatet
 * og en samling af kommandolinjeredskaber for afvikling af komplekse
   manipuleringer på VCF-filer.

Denne pakke indeholder flere værktøjer, der bruger biblioteket.

Other Packages Related to libvcflib-tools

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

  Bibliotek for entropimåling af bytestrømme

• dep: libfastahack0 (>= 0.0+git20160702.bbc645f)

  Bibliotek for indeksering og sekvensudtrækning fra FASTA-filer - bibliotek

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)

  GCC støttebibliotek

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

  Bestem lignende regioner mellem to strenge eller genomsekvenser - bibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: libtabixpp0t64 (>= 1.0.0)

  C++ wrapper to tabix indexer

• dep: libvcflib2 (>= 1.0.9+dfsg1)

  C++-bibliotek til at fortolke og manipulere VCF-filer

• dep: libwfa2-0 (>= 2.3.3)

  exact gap-affine algorithm (shared library)

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• dep: r-base-core

  GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem

• dep: r-cran-ggplot2

  Implementering af Grammar of Graphics

• dep: r-cran-gridbase

  GNU R-integration af base- og gittergrafik

• dep: r-cran-plyr

  tools for splitting, applying and combining data

• sug: r-cran-pracma

  Praktiske numeriske matematikfunktioner for GNU R

Download libvcflib-tools

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
mips64el	1.0.9+dfsg1-3+b2	605.3 kB	6,919.0 kB	[list of files]