Package: lumpy-sv (0.3.1+dfsg-7 and others)

[ Source: lumpy-sv  ]

Generel sandsynlighedsramme for strukturel variantregistrering

LUMPY, en lille SV-registreringsramme, der naturligt integrerer flere SV-signaler på tværs af flere prøver. LUMPY har forbedret sensitivitet, specielt når SV-signalet er reduceret til enten data med lav dækning eller lav intra-prøve variant allel frekvens.

Other Packages Related to lumpy-sv

• dep: bamkit

  Værktøjer for fælles BAM-filmanipulationer

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  Dynamisk bibliotek til at manipulere BAM-filer (genomsammenligning)

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libgzstream0 (>= 1.5+dfsg)

  Tilbyd funktionalitet for zlib C-bibliotek i en C++-iostrøm

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-pysam

  Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3

• dep: samblaster

  Markerer dubletter, udtrækker discordant/split-læsninger

• dep: samtools

  Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

• rec: sambamba

  Package not available

Download lumpy-sv

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	0.3.1+dfsg-7+b1	205.3 kB	689.0 kB	[list of files]
arm64	0.3.1+dfsg-7+b1	168.9 kB	677.0 kB	[list of files]
armel	0.3.1+dfsg-7+b1	162.2 kB	567.0 kB	[list of files]
armhf	0.3.1+dfsg-7+b1	169.2 kB	443.0 kB	[list of files]
i386	0.3.1+dfsg-7+b1	221.6 kB	735.0 kB	[list of files]
mips64el	0.3.1+dfsg-7+b1	175.8 kB	777.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.3.1+dfsg-7+b1	194.5 kB	805.0 kB	[list of files]
riscv64	0.3.1+dfsg-7+b2	189.7 kB	537.0 kB	[list of files]