Package: tvc (5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5 and others)

[ Source: tvc  ]

Genetisk variantkalder for Ion Torrent-sekventeringsplatforme

Torrent Variant Caller (TVC) er en genetisk variantkalder for Ion Torrent-sekventeringsplatforme og er specielt optimeret til at udnytte den underliggende flydende signalinformation i den statistiske model til at evaluere varianter. Torrent Variant Caller er designet til at kalde enkeltnukleotid polymorfier (SNP'er), flernukleotid polymorfier (MNP'er), indsættelser, sletninger og blokere substitutioner.

Other Packages Related to tvc

• dep: libarmadillo14 (>= 1:14.0.1+dfsg)

  streamlined C++ linear algebra library

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  Dynamisk bibliotek til at manipulere BAM-filer (genomsammenligning)

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

  Bibliotek for entropimåling af bytestrømme

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libjsoncpp26 (>= 1.9.6)

  Bibliotek til at læse og skrive JSON for C++

• dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

  Bestem lignende regioner mellem to strenge eller genomsekvenser - bibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download tvc

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
i386	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,117.9 kB	3,544.0 kB	[list of files]