Package: hinge (0.5.0-7 and others)

[ Source: hinge  ]

Assembler til læsning af lange genomer baseret på hinging

HINGE er en genomassembler, som forsøger at opnå optimal gentagelsesopslag ved at skelne gentagelser, som kan slås op givet dataene fra disse som ikke kan. Dette opnås ved at tilføje »hinges« til læsninger for at konstruere en graf med overlap hvor kun gentagelser, der ikke kunne slås op, sammenføjes. Som resultat kombinerer HINGE fejltolerancen for overlap-baserede assemblere med gentag-opslags funktioner for de Bruijn-grafassemblere.

Other Packages Related to hinge

• dep: daligner

  Lokal tilpasningsregistrering mellem lange nukleotidsekventeringslæsninger

• dep: dascrubber

  Sammenligningsbaseret scrubbing-datakanal for DNA-sekvenslæsninger

• dep: dazzdb

  Håndter data for nukleotidsekventeringslæsning

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libfmt9 (>= 9.0.0+ds1)

  Hurtigt type-sikkert C++-formateringsbibliotek - bibliotek

• dep: libgcc-s1 (>= 7)

  GCC støttebibliotek

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• dep: python3-colormap

  ease manipulation of matplotlib colormaps and color codecs (Python 3)

• dep: python3-matplotlib

  Pythonbaseret plotsystem i en stil der ligner Matlab

• dep: python3-networkx

  Værktøj til at oprette, manipulere og studere komplekse netværk - Python 3

• dep: python3-numpy

  Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget

• dep: python3-pbcore

  Python 3-bibliotek til at behandle PacBio-datafiler

• dep: python3-ujson

  Ultra hurtig JSON-koder og afkoder for Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download hinge

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
i386	0.5.0-7+b1	494.7 kB	3,511.0 kB	[list of files]