Package: ncbi-blast+ (2.16.0+ds-6)

[ Source: ncbi-blast+  ]

Næste generation programpakke for BLAST-sekvens søgeværktøjer

Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) er det mest udbredte sekvenssammenligningsværktøj. Der er versioner af BLAST som sammenligner proteinforespørgsler med proteindatabaser, nukleotide forespørgsler med nukleotide databaser samt versioner som oversætter nukleotide forepørgsler eller databaser i alle seks rammer og sammenligner med proteindatabaser eller forespørgsler. PSI-BLAST fremstiller en position-specifik-bedømmelse-matrix (PSSM) der starter med en proteinforespørgsel, og bruger så PSSM til at udføre yderligere søgninger. Det er også muligt at sammenligne en protein- eller nukleotidforespørgsel med en database med PSSM'er. NCBI'en understøtter en BLAST-hjemmeside på blast.ncbi-nlm.nih.gov samt en netværkstjeneste.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Purpose: use::analysing, works-with::biological-sequence

Other Packages Related to ncbi-blast+

• dep: libatomic1 (>= 4.8)

  Understøttelsesbibliotek der tilbyder __atomic indbyggede funktioner

• dep: libbz2-1.0

  højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  GCC støttebibliotek

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: liblmdb0 (>= 0.9.7)

  Lightning Memory-Mapped Database - delt bibliotek

• dep: libmbedcrypto7t64 (>= 2.28.0)

  Simpelt crypto- og SSL/TLS-bibliotek - crypto-bibliotek

• dep: libmbedtls14t64 (>= 2.28.0)

  Simpelt crypto- og SSL/TLS-bibliotek - tls-bibliotek

• dep: libmbedx509-1t64 (>= 2.28.0)

  Simpelt crypto- og SSL/TLS-bibliotek - x509-certifikatbibliotek

• dep: libnghttp2-14 (>= 1.28.0)

  Bibliotek der implementerer HTTP/2-protokollen - delt bibliotek

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  Nyt Perl Compatible Regular Expression Library- 8-bit kørselstidsfiler

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.6.12)

  Delt bibliotek til SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: libuv1t64 (>= 1.33.1)

  Asynkront hændelsespåmindelsesbibliotek - kørselstidsbibliotek

• dep: ncbi-data

  Platformsuafhængige data for NCBI-værktøjssættet

• dep: perl

  Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

• enh: t-coffee

  Flersekvensjustering

Download ncbi-blast+

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
armel	12,808.3 kB	57,045.0 kB	[list of files]