Package: blixem (4.44.1+dfsg-7.1 and others)

[ Source: seqtools  ]

Interaktiv browser for sekvenssammenligninger

Blixem er en interaktiv browser for sekvenssammenligninger, som er blevet stablet op i en »master-slave« multiple-sammenligning; det er ikke en »sand« multiple-sammenligning men en »en til mange«-sammenligning.

 * Overblikssektion der viser positionerne for gener og sammenligninger
   omkring sammenligningsvinduet
 * Detaljesektion der viser den faktiske sammenligning af proteinsekvenser
   eller nukleotid sekvenser til den genomiske DNA-sekvens
 * Vis sammenligninger mod begge tråde af referencesekvensen
 * Vis sekvenser i nukleotid eller proteintilstand; i proteintilstand vil
   Blixem vise tre-ramme oversættelsen af referencesekvensen
 * Rester fremhæves i forskellige farver afhængig af om de er præcise
   match, bevaret erstatning eller uden match
 * Hullede sammenligninger er understøttet, med indsættelser og sletning
   før fremhævelse i matchsekvensen
 * Matchninger kan sorteres og filtreres
 * SNP'er og andre variationer kan fremhæves i referencesekvensen
 * Poly(A)-haler kan vises og poly(A)-signaler fremhævet i
   referencesekvensen

Tags: Interface Toolkit: GTK

Other Packages Related to blixem

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  Cairo 2D - vektorgrafikbibliotek

• dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2)

  nemt at bruge adresseoverførelsesbibliotek for klientsiden (OpenSSL-variant)

• dep: libgbtools0t64 (>= 4.44.1+dfsg)

  Bibliotek til at visualisere sekvenssammenligninger

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  GCC støttebibliotek

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.76.0)

  GLib-bibliotek for C-rutiner

• dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.14.0)

  Grafisk brugergrænsefladebibliotek til GTK - ældre version

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Layout og optegning af internationaliseret tekst

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  Delt bibliotek til SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

Download blixem

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
armel	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,292.6 kB	2,060.0 kB	[list of files]