[ Source: srst2 ]
Package: srst2 (0.2.0-13)
Links for srst2
Debian Resources:
Download Source Package srst2:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [katholt.github.io]
Similar packages:
Kort læsesekvensindtastning for bakterielle patogener
Dette program er designet til at bruge Illumina-sekvensdata, en MLST-database og/eller en database med gensekvenser (f.eks. resistente gener, virulensgener etc.) og rapportere tilstedeværelsen af ST'er og/eller referencegener.
Other Packages Related to srst2
|
|
|
|
-
- dep: bowtie2
- Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner
-
- dep: cd-hit
- Programpakke designet til hurtigt at gruppere sekvenser
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-biopython
- Python 3-bibliotek for bioinformatik
-
- dep: python3-scipy
- Videnskabelige værktøjer for Python 3
-
- dep: samtools
- Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater
-
- rec: python3-rpy2
- Python 3-grænseflade til GNU R-sproget og miljøet - version 2
Download srst2
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| arm64 | 59.9 kB | 265.0 kB | [list of files] |