Package: python3-vcf (0.6.8+git20170215.476169c-10 and others)

[ Source: python-pyvcf  ]

Variant Call Format-fortolker (VCF) for Python 3

Variant Call Format (VCF) specificerer formatet for en tekstfil brugt i bioinformatik for lagring af gensekvensvariationer. Formatet er blevet udviklet med fremkomsten af genotyping i stor skala og DNA-sekventeringsprojekter, såsom 1.000 genomer-projektet.

Formålet med denne pakke er at efterligne modulet »csv« i Pythons standardbibliotek, modsat de mere fleksible serialiseringsformater såsom JSON eller YAML. »Vcf« vil forsøge at fortolke indholdet af hver post baseret på datatyperne specificeret i metainformationslinjerne - specifikt linjerne ##INFO og ##FORMAT. Hvis disse linjer mangler eller er ufuldstændige, så vil der kontrolleres mod de reserverede typer nævnt i specifikationen. Hvis det fejler, så vil det bare returnere strenge.

Denne pakke indeholder Python 3-modulerne.

Other Packages Related to python3-vcf

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.12~)

• dep: python3-pkg-resources

  Pakkesøgning og ressourceadgang med brug af pkg_resources

• dep: python3-pysam

  Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3

Download python3-vcf

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	0.6.8+git20170215.476169c-10+b1	49.1 kB	173.0 kB	[list of files]