Package: jmodeltest (2.1.10+dfsg-12)

[ Source: jmodeltest  ]

HPC-udvalg af modeller for nukleotid substitution

jModelTest er et værktøj til at udføre statistisk valg af bedst egnede modeller for nukleotidsubstitution. Værktøjet gennemfører fem forskellige modelselektionsstrategier: hierarkiske og dynamiske sandsynlighedskvotienttest (hLRT og dLRT), Akaike og bayesianske oplysningskriterier (AIC og BIC), og en beslutningsteorimetode (DT). Det giver også skøn over modeludvælgelsesusikkerheden, parametervigtighed og model-gennemsnit parameterestimater, herunder model-gennemsnit for trætopologier. jModelTest 2 omfatter High Performance Computing-funktioner (HPC) og ekstra funktioner som nye strategier for træoptimering, model- gennemsnit fylogenetiske træer (både topologi- og grenlængde), heuristisk filtrering og automatisk logning af brugeraktivitet.

Other Packages Related to jmodeltest

• dep: alter-sequence-alignment

  ALignment Transformation EnviRonment for arvemassesekvener

• dep: java-wrappers

  Omslag for kørbare filer for java

• dep: libmpj-java

  Javabibliotek for parallelle programmer for processorer med flere kerner og klynger

• dep: libpal-java

  Phylogenetic Analysis Library

• dep: phyml

  Fylogenisk estimering der bruger maksimum lIkelihood

Download jmodeltest

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	968.0 kB	2,694.0 kB	[list of files]