[ sid ]

Source Package: snippy (4.6.0+dfsg-5)

Links for snippy

The following binary packages are built from this source package:

snippy: Hurtig haploid-variantkald og kernegenomjustering
snippy-examples: Hurtig haploid-variantkald og kernegenomjustering - eksempler

adep: debhelper-compat (= 13)

Package not available
adep: any2fasta

Konverter diverse sekvensformater til FASTA
adep: bcftools

Genomisk variantkald og manipulering af VCF/BCF-filer
adep: bedtools

Programpakke med redskaber for sammenligning af arvemassefunktioner
adep: bwa

Burrows-Wheeler Aligner (sekvenssammenligner)
adep: freebayes

Bayesian haplotype-baseret polymorfiregistrering og genotypebestemmelse
adep: libbio-perl-perl

BioPerl - grundlæggende Perlmoduler
adep: libvcflib-tools

C++-bibliotek til at fortolke og manipulere VCF-filer - værktøjer
adep: minimap2

Alsidig parvis sammenligner for genomiske og opdelte nukleotide sekvenser
adep: parallel

Byg og afvikl kommandolinjer fra standardind parallelt
adep: samtools

Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater
adep: samclip

Filtrer SAM-fil for blødt og hårdt klippet sammenligninger
adep: seqtk

Hurtigt letvægtsværktøj til behandling af sekvenser i formaterne FASTA eller FASTQ
adep: snp-sites

Binær kode for pakken snp-sites
adep: snpeff

Genetisk variantannotation og effektforudsigelsesværktøjskasse - værktøj
adep: vt

Værktøjssæt for kort variant-registrering i genetiske sekvensdata

Debian Package Source Repository (VCS: Git): https://salsa.debian.org/med-team/snippy.git
Debian Package Source Repository (Browsable): https://salsa.debian.org/med-team/snippy