Source Package: bioperl-run (1.7.2-4)
Links for bioperl-run
Debian Resources:
Maintainers:
External Resources:
Other Packages Related to bioperl-run
-
- adep:
debhelper
(>= 11~)
- Hjælpeprogrammer for debian/rules
-
- idep:
perl
- Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
-
- idep:
libmodule-build-perl
- Ramme for bygning og installation af Perlmoduler
-
- idep:
bioperl
- Perlværktøjer til modellering af molekylær biologi
-
- idep:
libalgorithm-diff-perl
- modul til at finde forskelle mellem filer
-
- idep:
libipc-run-perl
- Perlmodul for kørsel af processer
-
- idep:
libio-string-perl
- Emuler IO::File-grænseflade for in-core-strenge
-
- idep:
libxml-twig-perl
- Perlmodul for behandling af store XML-dokumenter i trætilstand
-
- idep:
libtest-most-perl
- Perl module with the most commonly needed test functions and features
-
- idep:
libarray-compare-perl
- Perlmodul til nemt at sammenligne arrayer
-
- idep:
libtree-dagnode-perl
- Perl (super)class for representing nodes in a tree
-
- idep:
amap-align
- Proteinflerjustering af sekvensudglødning
-
- idep:
bedtools
- Programpakke med redskaber for sammenligning af arvemassefunktioner
-
- idep:
blast2
- Tom overgangspakke for ncbi-blast+-legacy
-
- idep:
bowtie
- Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner
-
- idep:
bwa
- Burrows-Wheeler Aligner (sekvenssammenligner)
-
- idep:
clustalw
- Global nukleotid eller peptid sekvensjustering
-
- idep:
emboss
- Programpakke til europæisk molekylærbiologi
-
- idep:
exonerate
- generisk værktøj til parvis sekvenssammenligning
-
- idep:
hmmer
- Profilskjulte Markov-modeller for proteinsekvensanalyse
-
- idep:
hyphy-mpi
- Hypotesetest ved hjælp af fylogenier - MPI-version
-
- idep:
infernal
- Logisk slutning for RNA-sekundære struktursammenligninger
-
- idep:
kalign
- Global og progressiv flersekvensjustering
-
- idep:
maq
- kortlægger korte, fast-længde, polymorfiske DNA-sekvenslæsninger til reference-sekvenser
-
- idep:
mafft
- Program til justering af flere aminosyrer eller nukleotide sekvenser
-
- idep:
muscle
- Flerjusteringsprogram for proteinsekvenser
-
- idep:
ncoils
- Coiled coil - sekundær strukturforudsigelse
-
- idep:
phylip
- Programpakke for udledning af fylogenier
-
- idep:
phyml
- Fylogenisk estimering der bruger maksimum lIkelihood
-
- idep:
primer3
- Værktøj til at designe flankerende, oligo-nukleotider til DNA-amplifikation
-
- idep:
probcons
- Flersekvens-sammenstilling baseret på probabilistisk konsistens (PROBabilistic CONSistency)
-
- idep:
raxml
- Randomized Axelerated Maximum Likelihood for pylogenetiske træer
-
- idep:
samtools
- Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater
-
- idep:
sim4
- Værktøj for justering af cDNA og genomisk DNA
-
- idep:
t-coffee
- Flersekvensjustering
-
- idep:
tigr-glimmer
- Gen-detektion i arkæer og bakterier
-
- idep:
wise
- Sammenligning af bioplymerer, såsom DNA- og protein-sekvenser
-
- idep:
libwww-perl
- Simpel og konsistent grænseflade til World Wide Web
