Source Package: bioperl-run (1.7.3-6)
Links for bioperl-run
Debian Resources:
Maintainers:
External Resources:
Other Packages Related to bioperl-run
-
- adep:
debhelper-compat
(= 13)
- Package not available
-
- idep:
perl
- Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
-
- idep:
libmodule-build-perl
- Ramme for bygning og installation af Perlmoduler
-
- idep:
bioperl
(>= 1.7.4)
- Perlværktøjer til modellering af molekylær biologi
-
- idep:
libalgorithm-diff-perl
- modul til at finde forskelle mellem filer
-
- idep:
libipc-run-perl
- Perlmodul for kørsel af processer
-
- idep:
libio-string-perl
- Emuler IO::File-grænseflade for in-core-strenge
-
- idep:
libxml-twig-perl
- Perlmodul for behandling af store XML-dokumenter i trætilstand
-
- idep:
libfile-sort-perl
- module to sort a file or merge sort multiple files
-
- idep:
libtest-most-perl
- Perl module with the most commonly needed test functions and features
-
- idep:
libarray-compare-perl
- Perlmodul til nemt at sammenligne arrayer
-
- idep:
libtree-dagnode-perl
- Perl (super)class for representing nodes in a tree
-
- idep:
libbio-cluster-perl
- BioPerl-klyngemoduler
-
- idep:
libbio-featureio-perl
- Moduler til at læse, skrive og manipulere sekvensfunktioner
-
- idep:
libconfig-any-perl
- module to load configuration from different file formats
-
- idep:
libbio-tools-run-alignment-clustalw-perl
- Bioperl-grænseflade til Clustal W
-
- idep:
libbio-eutilities-perl
- BioPerl-grænseflade til Entrez Programming Utilities - E-utilities
-
- idep:
libbio-tools-run-remoteblast-perl
- Objekt for ekstern afvikling af NCBI Blast via HTTP
-
- idep:
amap-align
- Proteinflerjustering af sekvensudglødning
-
- idep:
bedtools
- Programpakke med redskaber for sammenligning af arvemassefunktioner
-
- idep:
bedtools-test
- Testdata for pakken bedtools
-
- idep:
ncbi-blast+-legacy
- NCBI Blast-forældet kaldskript
-
- idep:
clustalw
- Global nukleotid eller peptid sekvensjustering
-
- idep:
emboss
- Programpakke til europæisk molekylærbiologi
-
- idep:
exonerate
- generisk værktøj til parvis sekvenssammenligning
-
- idep:
hmmer
[any-amd64 any-i386 powerpc ppc64]
- Profilskjulte Markov-modeller for proteinsekvensanalyse
-
- idep:
hyphy-pt
- Hypotesetest ved hjælp af fylogenier - pthreads-version
- or
hyphy-mpi
- Hypotesetest ved hjælp af fylogenier - MPI-version
-
- idep:
infernal
[any-amd64 any-i386]
- Logisk slutning for RNA-sekundære struktursammenligninger
-
- idep:
kalign
- Global og progressiv flersekvensjustering
-
- idep:
mafft
- Program til justering af flere aminosyrer eller nukleotide sekvenser
-
- idep:
muscle
- Flerjusteringsprogram for proteinsekvenser
-
- idep:
ncoils
- Coiled coil - sekundær strukturforudsigelse
-
- idep:
phyml
- Fylogenisk estimering der bruger maksimum lIkelihood
-
- idep:
primer3
- Værktøj til at designe flankerende, oligo-nukleotider til DNA-amplifikation
-
- idep:
probcons
- Flersekvens-sammenstilling baseret på probabilistisk konsistens (PROBabilistic CONSistency)
-
- idep:
python3-pybedtools
- Python 3-omslag omkring BEDTools for bioinformatikarbejde
-
- idep:
raxml
- Randomized Axelerated Maximum Likelihood for pylogenetiske træer
-
- idep:
samtools
- Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater
-
- idep:
sim4
- Værktøj for justering af cDNA og genomisk DNA
-
- idep:
tigr-glimmer
- Gen-detektion i arkæer og bakterier
-
- idep:
wise
- Sammenligning af bioplymerer, såsom DNA- og protein-sekvenser
-
- idep:
fasttree
- Fylogenetiske træer fra opstillinger af nukleotid- eller proteinsekvenser
-
- idep:
lagan
- Parameteropsat parvist og globalt sammenligningsprogram for genomsekvenser
-
- idep:
pal2nal
- Konverterer proteiner til genomisk DNA-sammenligning
-
- idep:
pftools
[any-amd64]
- Byg og søg protein- og DNA-generaliserede profiler
-
- idep:
libwww-perl
- Simpel og konsistent grænseflade til World Wide Web
