Source Package: trinityrnaseq (2.11.0+dfsg-6)
Links for trinityrnaseq
Debian Resources:
Maintainers:
External Resources:
The following binary packages are built from this source package:
- trinityrnaseq
- RNA-Seq De novo Assembly
- trinityrnaseq-examples
- NA-Seq De novo Assembly - fælles eksempel- og testfiler
Other Packages Related to trinityrnaseq
-
- adep:
debhelper-compat
(= 13)
- Package not available
-
- adep:
jellyfish
- Tæl k-mers i DNA-sekvenser
-
- adep:
libjung-free-java
- Java Universal Network/Graph Framework
-
- adep:
javahelper
- Hjælpeskripter for pakning af Javaprogrammer
-
- adep:
libgetopt-java
- GNU getopt - Javaport
-
- adep:
default-jdk
- Standard-Java eller Java-kompatibelt Development Kit
-
- adep:
parafly
- Parallel kommandobehandling via OpenMP
-
- adep:
libjs-jquery
- JavaScript-bibliotek for dynamiske internetprogrammer
-
- adep:
jaligner
- Smith-Waterman-algoritme med Gotohs forbedring
-
- adep:
libhts-dev
- Udviklingsfiler for HTSlib
-
- adep:
bowtie2
- Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner
-
- adep:
salmon
- Wicked-hurtig transskriptkvantificering fra RNA-seq-data
-
- adep:
zlib1g-dev
- Komprimeringsbibliotek - udvikling
-
- adep:
cmake
- open source make-system for flere platforme
-
- adep:
r-bioc-edger
- Empirisk analyse af digitale gen-udtryksdata i R
-
- adep:
r-bioc-deseq2
- R-pakke for RNS-Seq-differentiel udtryksanalyse
-
- adep:
r-bioc-rots
- GNU R-reproducerbarhedsoptimeret teststatistik
-
- adep:
r-cran-fastcluster
- Hurtige hierarkiske klyngerutiner for GNU R
-
- adep:
liburi-perl
- modul til at manipulere og tilgå URI-strenge
-
- adep:
r-cran-ape
- GNU R-pakke for Analyses of Phylogenetics and Evolution
-
- adep:
r-bioc-ctc
- Klynge- og trækonvertering
-
- adep:
r-cran-gplots
- GNU R-pakke med værktøjer for plot af data af Greg Warnes m.fl.
-
- adep:
r-cran-readr
- GNU R package to read rectangular text data
-
- adep:
r-bioc-biobase
- Grundlæggende funktioner for Bioconductor
-
- adep:
r-bioc-qvalue
- GNU R-pakke for Q-værdiestimering for FDR-kontrol
-
- adep:
r-bioc-goseq
- GNU r-genontologianalyseprogram for RNA-seq og andre længdeforstyrrede data
-
- adep:
r-bioc-tximport
- Estimater på transkriptniveau for biologisk sekventering
-
- adep:
python3-htseq
- Python 3-redskaber til høj-gennemløb læseanalyse af genomsekventeringer
-
- adep:
rna-star
- Ultrahurtig univerel RNA-seq-sammenligningsprogram
-
- adep:
picard-tools
- Kommandolinjeværktøjer til at manipulere SAM- og BAM-filer
-
- adep:
gmap
- Opdelt og SNP-overholdende justering for mRNA og korte læsninger
-
- adep:
hisat2
- Grafbaseret sammenligning af korte nukleoide læsninger for mange genomer
-
- adep:
subread
- Værktøjssæt til at behandle næstegen. sekvensdata
-
- adep:
kallisto
- Næsten optimal RNA-Seq-kvantificering
-
- adep:
python3-hisat2
- Pythonskripter der følger med hisat2
-
- adep:
r-cran-argparse
- GNU R-kommandolinjefortolker for valgfrie og positionelle argumenter
-
- adep:
r-bioc-dexseq
- GNU R inference of differential exon usage in RNA-Seq
-
- adep:
tabix
- Generisk indeksprogram for TAB-afgrænsede arvemassepositionsfiler
