Package: libvcflib1 (1.0.3+dfsg-2) [debports]

[ Source:  ]

C++-bibliotek til at fortolke og manipulere VCF-filer

Variant Call Format (VCF) er en flad fil, indryk afgrænser tekstformatet, lavet til præcist at beskrive referenceindekserede variationer mellem individer. VCF tilbyder et fælles udvekslingsformat for beskrivelsen af variation i individer og befolkninger, og har nogle standardformater til rapportering for en bred vifte af registreringsprogrammer til genvarianter.

Vcflib tilbyder metoder til at manipulere og fortolke sekvensvariation som det er beskrevet af VCF. Det er både:

 * en API til at fortolke og arbejde på poster med genvariation, som
   det kan beskrives af VCF-formatet
 * og en samling af kommandolinjeredskaber for afvikling af komplekse
   manipuleringer på VCF-filer.

Other Packages Related to libvcflib1

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

  Bibliotek for entropimåling af bytestrømme

• dep: libfastahack0 (>= 0.0+git20160702.bbc645f)

  Bibliotek for indeksering og sekvensudtrækning fra FASTA-filer - bibliotek

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  GCC støttebibliotek

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

  Bestem lignende regioner mellem to strenge eller genomsekvenser - bibliotek

• dep: libssw0 (>= 1.1)

  fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

  C++ wrapper to tabix indexer

Download libvcflib1

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
sparc64 (unofficial port)	123.4 kB	1,057.0 kB	[list of files]