Partial Order Alignment for flere sekvenssammenligninger
POA er Partial Order Alignment, et hurtigt program for flere
sekvenssammenligninger (MSA) i bioinformatik. Dets fordele er hastighed,
skalabilitet, sensitivitet og den overlegne evne til at håndtere
forgrening/indels i sammenligningen. Delvis rækkesammenligning er en
tilgang til MSA, som kan kombineres med de eksisterende metoder, såsom
gradvis sammenligning. POA sammenligner optimalt et par MSA'er, og kan
derfor anvendes direkte til progressive sammenligningsmetoder såsom
CLUSTAL. For store sammenligninger er Progressive POA 10-30 gange hurtigere
end CLUSTALW.
