Package: belvu (4.44.1+dfsg-7.1 and others)

[ Source: seqtools  ]

Fremviser for flere sekvenssammenligninger og et fylogenetisk værktøj

Belvu er en fremviser for flere sekvenssammenligninger og et fylogenetisk værktøj med et omfattende sæt af tilstand, der kan konfigureres af brugeren, til at farvelægge rester.

 * Se flere sekvenssammenligninger
 * Rester kan farvelægges ved konservering, med afskæringer og farver
   konfigureret af brugeren
 * Rester kan farves efter resttype (brugerkonfigureret)
 * Farveskemaer kan importeres og eksporteres
 * Swissprot-elementer (eller PIR) kan hentes ved dobbeltklik
 * Positionen for sammenligningen kan nemt spores
 * Manuel sletning af rækker og kolonner
 * Automatisk redigering af rækker og kolonner baseret på tilpassede
   kriterier:
   - fjernelse af alle-huller-kolonner
   - fjernelse af alle huller
   - fjernelse af overflødige sekvenser
   - filtrering af sekvenser ved procentidentitet
   - fjernelse af sekvenser efter en af brugeren angivet procent for
     huller
   - fjernelse af delvise sekvenser (dem startende eller sluttende med
     huller) og
   - fjernelse af kolonner ved konservering (med brugerangivne øvre/
     nedre afskæringer)
 * Sammenligningen kan gemmes formaterne Stockholm, Selex, MSF eller FASTA
 * Afstandsmatricer mellem sekvenser kan oprettes via en række af
   afstandsmatricer
 * Afstandsmatricer kan importeres eller eksporteres
 * Fylogenetiske træer kan konstrueres baseret på diverse afstandsbaserede
   trærekonstruktionsalgoritmer
 * Træer kan gemmes i formatet New Hampshire
 * Belvu kan udføre bootstrap-fylogenetisk rekonstruktion

Tags: Interface Toolkit: GTK

Other Packages Related to belvu

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  Cairo 2D - vektorgrafikbibliotek

• dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2)

  nemt at bruge adresseoverførelsesbibliotek for klientsiden (OpenSSL-variant)

• dep: libgbtools0t64 (>= 4.44.1+dfsg)

  Bibliotek til at visualisere sekvenssammenligninger

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.22.0)

  GLib-bibliotek for C-rutiner

• dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.12.0)

  Grafisk brugergrænsefladebibliotek til GTK - ældre version

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Layout og optegning af internationaliseret tekst

• dep: libstdc++6 (>= 4.1.1)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

Download belvu

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
s390x	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,025.8 kB	1,247.0 kB	[list of files]